- Kukci: Leptiri - do sada je za park zabilježeno 18 vrsta dnevnih leptira i dominiraju vrste iz porodice šarenaca. Mravi - u našem parku živi 35 vrsta mrava.
- Vodozemci: Ovdje živi jedna jako prilagodljiva kopnena vrsta, a to je zelena krastača .
- Gmazovi: Gušteri - osim dviju vrsta gušterica - primorske gušterice i krške gušterice , ovdje obitava i kućni macaklin koji je večernja odnosno noćna životinja. Zanimljivo je da macaklin na nogama ima prijanjaljke koje mu omogućavaju da se penje po stropu pa čak i po staklu.
- Zmije - ovdje obitavaju četiri vrste zmija – zmajur, kravosas, šara poljarica i crvenkrpica. Podaci o postojanju otrovnica u parku ne postoje.
- Ptice: U parku postoje dvije relativno veće kolonije galeba klaukavca. Osim kolonije galebova, tu je i kolonija morskog vranca sa približno 150 pari, zatim kolonije triju vrsta čiopa - bijela čiopa, čiopa i smeđa čiopa . Zanimljivost čine i nekoliko gnijezda sivog sokola, ušare i gavrana. Od pjevica ovdje gnijezde: primorska bjeloguza, crnoglava grmuša, bjelobrka grmuša, primorska trepteljka, modrokos, kamenjar i brojne druge ptičje vrste.Kornati su posebno zanimljivi u doba migracija ptica, kada se na ovom prostoru mogu vidjeti brojne vrste selica poput atraktivnih ždralova, vlastelica, sivih čaplji i mnogih drugih.
- Sisavci: Ovo područje nije baš stvoreno za krupne predatore (konfiguracija terena, malene površine i ograničenje hrane i vode), ali je zato na otoku Kornatu prisutna kuna, koja je najvjerojatnije uspjela istrijebiti kornatsku populaciju zeca prisutnu do prije dvadesetak godina. Naravno, vrijedno je spomenuti i desetak vrsta šišmiša koji su zabilježeni u parku.
- Potvrđen je nalaz endemske vrste rakušca Niphargus pectencoronatae i Niphargus hebereri.